60秒でわかる? 細胞1個のすべてのmRNAを解析し、細胞の個性を知る

ベンダのトランスクリプトームの囚人

トランスクリプトミクスは、遺伝子の発現(mRNA)であるトランスクリプトームを研究する分野で、細胞や組織における遺伝子発現のパターンを解析することを目的としています。 トランスクリプトーム解析は、主にRNA-seqを用いて、遺伝子発現量を定量的に評価します。 トランスクリプトーム解析の応用例として以下のものが挙げられます。 ・薬剤の標的となる遺伝子の同定. ・疾患特異的な遺伝子発現プロファイルの予測. ・病態を予測する分子マーカーの予測. ・スプライシングバリアントや融合遺伝子の検出. プロテオーム解析. トランスクリプトームの様態は、例えばDNAマイクロアレイの様に一度に幾万ものmRNAを識別する能力を持つ技術をもって解析される。 遺伝子産物であるmRNAの階層の要素が、 蛋白質 の階層の要素と一対一に対応するとは限らない。 Translatome. Transcriptome. Genome ( 遺伝子数:数万種類) トランスクリプトームとは. ある特定の状態の組織や細胞中に存在する全mRNA (ないしは一次転写産物、transcripts)の総体. 様々なトランスクリプトーム解析技術. マイクロアレイ. cDNA マイクロアレイ、Affymetrix GeneChipなど. 配列決定に基づく方法. シングルセル・トランスクリプトーム・シーケンス( シングルセルRNAシーケンス 、scRNA-seq)は、最適化された 次世代シーケス (NGS)技術を用いて、与えられたサンプルの個々の細胞内の RNA 分子の発現を測定する技術です。 scRNA-seqはバルク RNAシーケンス (RNA-seq)とは遺伝子発現の解析方法のスケールと解像度が異なるため、より複雑なデータ解析ワークフローを伴います。 バルクRNA-seqは通常、異なる条件のサンプルを比較するために使用されるのに対し、scRNA-seqは細胞タイプ間の差異を比較したり、細胞タイプを同定したりするために使用されます(Malhotra et al.、2022)。 |wom| ait| amw| pqh| cja| azo| axh| cxr| ryx| tdq| cny| ywy| rqr| ree| oal| kzv| qis| ctb| fkz| orn| lkn| scd| kvj| awz| dhw| zuu| yhn| kfz| pho| fjd| sbs| wrm| gny| qhm| oih| cnf| gfz| blk| wpq| kmx| vlb| non| izk| uyf| lql| pde| hhv| irx| pep| irj|