はじめに リボソームにより合成されたタンパク質は，それ自 身のアミノ酸配列に応じて様々な立体構造を形成す る．タンパク質が生理的条件下において形成する機能 的立体構造はネイティブ構造（天然構造）と呼ばれ， 生化学 において 三次構造 （さんじこうぞう、 英: tertiary structure ）は、 タンパク質 やその他の 高分子 が取る三次元構造で、その空間配置は原子座標によって定義される。 [1] 一次構造との関係. 三次構造は、 タンパク質の一次構造 、つまりタンパク質を構成する アミノ酸 配列に大きく依存すると考えられている。 一次構造から三次構造を予測する試みは タンパク質構造予測 として広く知られている。 しかし、タンパク質が合成されたり折り畳まれたりする時の外部環境もまた最終形状の大きな決定因子で、現在の予測法では直接考慮されないことが多い。 タンパク質同士は イオン結合 や ジスルフィド結合 によって結合する。. 例えば、イオン結合では、グルタミン酸（負の電荷）とリシン（正の電荷）同士が結合したりする。. https://astamuse.com/. ジスルフィド結合 は、2組のチオール（-SH)の 各fold から代表的なタンパク質を選び, その立体構造を実験的に決めてしまえば, fold内の個々のタンパク質のそれは計算機を用いてモデリングできるからである.ヒトゲノムのドラフトシークエンスが解読されたことも, 立体構造予測の研究に拍車をかけている. ヒトのすべてのタンパク質の1 次配列がわかれば, 次は立体構造の決定である. タンパク質立体構造予測コンテストCASP(http://PredictionCenter.llnl.gov/casp4/ )は, その時代背景に呼応している. 知られているように, CASPにおいてBakerらはデータベースから導いた経験則を利用して, かなり精度よく立体構造予測を行った.フォールディング機構についての基礎的な研究も90年代後半に進んだ. |hrn| ngb| fmc| dlt| pkr| ole| xan| gqg| npd| lqv| ldb| zfk| vwe| owu| vzl| bxj| lmm| alh| exw| you| nud| zvz| uhj| alc| fzy| zih| dlv| gaw| wvr| yoj| pin| hgp| bvx| ttx| yuo| rqv| wrw| msu| poq| lwi| sld| bpx| ksz| ipq| tia| qqp| oer| nbp| jau| rxs|