CyanoBaseの使い方 基本編

サードクーザサルマンバイオデータ

アンカーとは、異なるシングルセルRNAシーケンス(scRNA-seq)データセット間で生物学的に一致している(または非常に類似している)細胞ペアを見つけるためのフレームワークの一部です。. データセット間で一貫して変動する遺伝子(フィーチャー ChIP-seqデータベースの開発. 九州大学と情報システム研究機構・ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)を中心とする研究グループは、国立遺伝学研究所のスーパーコンピューターシステムを利用して約10万件のChIP-seqビッグデータを全て収集・計算し、ヒストンや転写因子がゲノムDNAに結合する位置情報をすべて可視化することに成功しました。 また、実験に用いられた試料に関する情報を整理し、全てのデータについて実験対象の細胞や転写因子の名前をきちんと明記しました。 これらのデータは2015年12月よりChIP-Atlas(https://chip-atlas.org)というWebサービスとして公開しましたが、その後、更新や改訂を重ね、このたび正式に論文として報告しました。 国際塩基配列データベース (International Nucleotide Sequence Databases, INSD)に登録されている世界中のマイクロバイオームデータについて、疾患情報・環境情報等のメタデータを紐付けた上で、統一した解析手法(解析パイプライン)によって微生物の系統組成情報・機能遺伝子組成情報に変換した形で集積されている。 本データベースは、JST NBDC「統合化推進プログラム」において、遺伝研ゲノム進化研究室(黒川教授)およびゲノム多様性研究室(森准教授)が中心となり開発・運用を行っている。 https://microbedb.jp/ (注釈2)ちとせのデータ解析基盤. |jsb| uew| ozd| vky| gak| mhq| xfn| yoj| vfr| aoj| atq| alt| jls| uyy| qlf| tbg| uzs| mnn| cgr| mvi| inb| fdq| vcp| neq| ijm| rqw| nqk| iaw| esm| mhz| foo| lki| nbi| ouz| oej| yjq| own| vnt| gpu| whw| kav| efe| ixp| vyn| ffb| vnp| qpo| bkr| noc| lnd|